counter for colours
「色」 has other readings with different meanings.
colour; color; hue; tint; tinge; shade
rupa (form)
この花は全部で三色あるよ。
This flower comes in three colors total.
五色のクレヨンで絵を描きました。
I drew a picture with five colors of crayons.
何色のペンを使えばいいか迷っている。
I'm not sure which color pen to use.